MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 2757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017293	GAAA	2	8	50	57	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017293	TCT	2	6	95	100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017293	CGG	2	6	120	125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017293	GTT	2	6	172	177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017293	AGGGA	2	10	304	313	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017293	TGCT	2	8	353	360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017293	GCA	2	6	409	414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017293	CT	3	6	469	474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017293	GTCG	2	8	482	489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017293	GTT	2	6	579	584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017293	CCT	2	6	595	600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017293	CGT	2	6	616	621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017293	GCT	2	6	688	693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017293	GCA	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017293	AGGG	2	8	775	782	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017293	TGC	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017293	GCA	2	6	814	819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017293	CAC	2	6	858	863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017293	AC	3	6	870	875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017293	ACG	2	6	919	924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017293	TCACG	2	10	925	934	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017293	GGA	2	6	959	964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017293	ATG	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017293	TGG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017293	CGA	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017293	CT	3	6	1053	1058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017293	TAG	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017293	C	8	8	1114	1121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_017293	ACT	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017293	GTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017293	AAC	2	6	1237	1242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017293	TGC	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017293	GCA	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017293	TA	3	6	1343	1348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017293	GGA	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017293	GGACG	2	10	1458	1467	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017293	AAC	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017293	ATG	2	6	1568	1573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017293	CG	3	6	1581	1586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017293	GGTG	2	8	1592	1599	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017293	CACGC	2	10	1782	1791	20 %	0 %	20 %	60 %	409191059
42	NC_017293	GC	3	6	1790	1795	0 %	0 %	50 %	50 %	409191059
43	NC_017293	GCA	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191059
44	NC_017293	GTG	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191059
45	NC_017293	AT	3	6	1885	1890	50 %	50 %	0 %	0 %	409191059
46	NC_017293	GCA	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191059
47	NC_017293	TAGT	2	8	1918	1925	25 %	50 %	25 %	0 %	409191059
48	NC_017293	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191059
49	NC_017293	GTA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
50	NC_017293	ATG	2	6	2013	2018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
51	NC_017293	ATA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191059
52	NC_017293	CAAG	2	8	2210	2217	50 %	0 %	25 %	25 %	409191059
53	NC_017293	TCA	2	6	2233	2238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191059
54	NC_017293	GTCT	2	8	2300	2307	0 %	50 %	25 %	25 %	409191059
55	NC_017293	GGCTA	2	10	2312	2321	20 %	20 %	40 %	20 %	409191059
56	NC_017293	GTC	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191059
57	NC_017293	ATG	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
58	NC_017293	CTG	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017293	CAA	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017293	GAC	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017293	TGC	2	6	2614	2619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017293	AGG	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017293	GCC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017293	ACG	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017293	GC	3	6	2868	2873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017293	GCCT	2	8	2964	2971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017293	AACT	2	8	2995	3002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017293	CAG	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017293	CCTT	2	8	3017	3024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017293	TGC	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017293	AGG	3	9	3128	3136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191060
72	NC_017293	TGTGC	2	10	3149	3158	0 %	40 %	40 %	20 %	409191060
73	NC_017293	GCGG	2	8	3159	3166	0 %	0 %	75 %	25 %	409191060
74	NC_017293	GTT	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191060
75	NC_017293	TTGC	2	8	3224	3231	0 %	50 %	25 %	25 %	409191060
76	NC_017293	GCC	2	6	3256	3261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191060
77	NC_017293	CCT	3	9	3275	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191060
78	NC_017293	CAT	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191060
79	NC_017293	TGC	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191060
80	NC_017293	CGC	2	6	3324	3329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191060
81	NC_017293	TGG	2	6	3402	3407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017293	CCT	2	6	3433	3438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017293	TGC	2	6	3465	3470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017293	GCG	2	6	3480	3485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017293	CAA	2	6	3567	3572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017293	ACG	2	6	3588	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017293	ACG	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017293	GCTG	2	8	3682	3689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017293	TGC	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017293	GCTG	2	8	3729	3736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017293	CTT	2	6	3741	3746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017293	GCG	2	6	3824	3829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017293	CTGG	2	8	3866	3873	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017293	GTT	2	6	3891	3896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017293	ACG	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017293	AGT	2	6	3945	3950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017293	ACT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017293	CAA	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017293	GCTG	2	8	4107	4114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017293	CGT	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017293	GCCTG	2	10	4138	4147	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017293	TGC	2	6	4173	4178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017293	AGC	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017293	TCG	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017293	CTG	2	6	4403	4408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017293	TCTT	2	8	4444	4451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017293	TGC	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017293	GCT	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017293	GCAG	2	8	4629	4636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017293	GAT	2	6	4637	4642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017293	GCT	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017293	GCTGG	2	10	4662	4671	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017293	GAG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017293	AGC	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017293	ACA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017293	GC	3	6	4846	4851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017293	GCGA	2	8	4861	4868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017293	AGGC	2	8	4913	4920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017293	GCA	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017293	ATGC	2	8	4981	4988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017293	GCACA	2	10	4999	5008	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017293	GCC	2	6	5009	5014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017293	TGG	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017293	GC	3	6	5042	5047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017293	CGG	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017293	GC	3	6	5114	5119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017293	TGA	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017293	CGC	2	6	5187	5192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017293	CG	4	8	5244	5251	0 %	0 %	50 %	50 %	409191061
130	NC_017293	GCA	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191061
131	NC_017293	GGAT	2	8	5532	5539	25 %	25 %	50 %	0 %	409191061
132	NC_017293	GCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191061
133	NC_017293	GAT	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191061
134	NC_017293	GCA	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191062
135	NC_017293	GGT	2	6	5762	5767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191062
136	NC_017293	CGG	3	9	5783	5791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191062
137	NC_017293	TGG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191062
138	NC_017293	AAG	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191062
139	NC_017293	AGG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191062
140	NC_017293	TGC	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191063
141	NC_017293	CTGTG	2	10	5995	6004	0 %	40 %	40 %	20 %	409191063
142	NC_017293	GCG	2	6	6042	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191063
143	NC_017293	GCG	2	6	6072	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191063
144	NC_017293	TCTG	2	8	6102	6109	0 %	50 %	25 %	25 %	409191063
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270	NC_017293	GCT	2	6	11891	11896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_017293	GCGCC	2	10	11907	11916	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
272	NC_017293	GCTG	2	8	11919	11926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
273	NC_017293	CGC	2	6	11942	11947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_017293	CAG	2	6	11967	11972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_017293	CA	4	8	11975	11982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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282	NC_017293	GAT	2	6	12214	12219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191067
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342	NC_017293	GCCT	2	8	15580	15587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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406	NC_017293	TG	3	6	18091	18096	0 %	50 %	50 %	0 %	409191072
407	NC_017293	GTT	2	6	18108	18113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_017293	TCC	3	9	18156	18164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191073
409	NC_017293	CTA	2	6	18298	18303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191073
410	NC_017293	TCC	2	6	18372	18377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191073
411	NC_017293	CGC	2	6	18482	18487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_017293	GCT	2	6	18535	18540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191074
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416	NC_017293	GC	3	6	18649	18654	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
417	NC_017293	AAC	2	6	18672	18677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191074
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445	NC_017293	CCT	2	6	20318	20323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191074
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478	NC_017293	CTAT	2	8	21979	21986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_017293	ACG	2	6	22192	22197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191075
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487	NC_017293	TCC	2	6	22561	22566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191075
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